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Portail > Offres > Offre UMR7564-XAVBEL-003 - Technicien en microbiologie et biologie moléculaire H/F

Technicien en microbiologie et biologie moléculaire H/F


Date Limite Candidature : vendredi 7 octobre 2022

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Informations générales

Référence : UMR7564-XAVBEL-003
Lieu de travail : VANDOEUVRE LES NANCY
Date de publication : vendredi 16 septembre 2022
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 7 mois
Date d'embauche prévue : 17 octobre 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 1800 et 2000 € bruts mensuels
Niveau d'études souhaité : Bac+2
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Le travail proposé s'inscrit dans le cadre du projet européen ANTIVERSA dont le but est de comprendre l'invasion de communautés microbiennes naturelles (aquatiques ou de sol) par des déterminants génétiques de l'antibiorésistance (gènes de résistance / éléments génétiques mobiles) apportés par une source anthropique sous forme d'ADN extracellulaire, des phages/vésicules transductrices ou des bactéries résistantes. Le travail attendu couvrira des études de terrain et en microcosmes pour suivre la dissémination de gènes de résistance aux antibiotiques dans des communautés microbiennes environnementales. Ces études d'invasion de communautés s'appuieront sur un panel d'approches moléculaires, essentiellement de la PCR quantitative (qPCR et ddPCR), adaptées au traçage des transferts de gènes horizontaux par différentes voies (transformation, transduction, conjugaison). Ce travail sera effectué en collaboration avec les microbiologistes d'un consortium européen, tous impliqués dans l'étude de la dissémination de l'antibiorésistance dans l'environnement mais avec des spécialités allant de l'écologie moléculaire à la génétique microbienne en passant par la microbiologie environnementale. Le but du consortium est d'identifier des paramètres environnementaux clés régissant la propagation de l'antibiorésistance vers des communautés naturelles, en particulier lorsqu'elles sont altérées et exposées à des pressions anthropiques.

Activités

- Collecte et traitement d'échantillons environnementaux (sols, biofilms aquatiques)
- Extraction d'ADN de communautés microbiennes
- Maintien de communautés collectées en microcosmes contrôlés (bioréacteurs)
- Expérience d'invasion en microcosme par apport exogène de gènes de résistance aux antibiotiques (ADN libre, phages environnementaux, panel de bactéries résistantes)
- Analyse quantitative de la dissémination par biologie moléculaire (ex. qPCR)

Compétences

Microbiologiste de formation, le (la) candidat(e) devra présenter de solides compétences techniques et théoriques en biologie moléculaire et éventuellement en microbiologie environnementale. Une bonne maitrise de la PCR quantitative est indispensable. S'agissant de transfert de gènes horizontaux, il est entendu que la personne recrutée ait un certain niveau de connaissance sur ces mécanismes d'évolution bactérienne.

Contexte de travail

Le (la) lauréat(e) sera affecté(e) au LCPME (UMR 7564 UL-CNRS) qui regroupe 79 personnes distribuées dans trois équipes. Le (la) recruté(e) intègrera l'équipe de Microbiologie Environnementale sur sa thématique "dissémination de l'antibiorésistance dans l'environnement" sous la direction de Christophe Merlin et Xavier Bellanger. Le projet auquel le (la) recruté(e) sera affecté(e) se déroulera dans le contexte très particulier d'une collaboration internationale regroupant 6 partenaires dont le but est d'apporter collectivement un éclairage sur l'importance de la biodiversité microbienne dans la dissémination de l'antibiorésistance dans l'environnement.

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