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Portail > Offres > Offre UMR6539-ANNPOD-030 - Ingénieur(e) d'études en bioinformatique (H/F)

Ingénieur(e) d'études en bioinformatique (H/F)


Date Limite Candidature : lundi 26 juillet 2021

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Informations générales

Référence : UMR6539-ANNPOD-030
Lieu de travail : PLOUZANE
Date de publication : lundi 5 juillet 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 1 octobre 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2109,54€ et 2 528,13€ bruts mensuels
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

L'Ingénieur(e) aura en charge le traitement bio-informatique et biostatistiques de l'ensemble des données de génomiques et de métagénomiques de la station SOMLIT ( 2014 - 2021) afin d'analyser la dynamique et l'évolution des communauté de microorganismes procaryotes de l'observatoire Génomique des micro-organismes de la rade de BREST (MICROBREST).

Activités

Les activités seront les suivantes :
-Réception et traitement qualité des données brutes de séquencage métabarcoding et métagenomique
-Analyse bioinformatique des données metabarcoding et metagenomique
- Production des figures en vue de la valorisation des résultats
- Participation à l'écriture des articles de valorisation
- Participation ponctuelle à l'échantillonnage
- Développement d'analyses en génomique environnementale.

Compétences

Master de Microbiologie,
Compétences en écogénomique, bioinformatique et biostatistique appliqué à l'étude des communautés microbiennes marines,
Statistiques (maîtrise)
Techniques statistiques et informatiques de collecte et de traitement de données (maîtrise)
Outils et méthodes de projection (maîtrise)
Logiciels statistiques (maîtrise)
Langages de programmation
Travail en équipe
Autonomie
Sens de l'organisation et des priorités
Sens du relationnel
Curiosité intellectuelle

Contexte de travail

La mission s'effectuera au sein de l'Institut Universitaire Européen de la mer, au sein du LEMAR et du LM2E, laboratoires de recherche qui dépendent de plusieurs tutelles (CNRS, UBO, IRD, Ifremer). Ponctuellement, des prélèvements à SOMLIT (Saint Anne du Portzic, rade de Brest) et quelques expérimentations eu Lemar (salle de filtration).

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