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Recherche ingénieur-e d'étude en microbiologie (bactéries pathogènes et bactériophages), biologie moléculaire et bio-informatique (H/F)


Date Limite Candidature : jeudi 20 mai 2021

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Informations générales

Référence : UMR5290-REMFRO-002
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : jeudi 29 avril 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 7 juin 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : environ 2100€/mois (brut)
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Isolement et caractérisation génomique et phénotypique de bactéries (Salmonella enterica enterica) et bactériophages

Activités

Les différentes tâches à réaliser seront :
- Microbiologie 1: isolement de bactéries cibles Salmonella enterica enterica sur milieux sélectifs
- Microbiologie 2: isolement, purification et amplification de bactériophages sur les souches isolées de Salmonella enterica à partir de solutions d'origines diverses;
- Microbiologie 3: mesure de burst-size et de taux d'adsorption
- Microbiologie 4: évolution expérimentale
- Biologie moléculaire 1: génotypage et séquençage génome complet de bactériophages (Illumina/MinIon)
- Biologie moléculaire 2: création de banque d'insertion de transposon / séquençage INSeq
- Biologie moléculaire 3: insertion de marqueurs fluorescent et luminescent dans les bactéries d'intérêts
- Bio-informatique : reconstruction des séquences Illumina/MinIon et analyses

Compétences

microbiologie classique (couler des boites de LB-agar, double-couche, préparation de solutions nutritives stériles, etc), gestion du matériel & matériel, biologie moléculaire (électrophorèse ADN & protéique, Purification d'ADN, transformation / création de bactéries compétentes, PCR, qPCR, design amorces, séquençage Illumina iSeq et MinIon)

Contexte de travail

Le travail se fera au sein du centre IRD (Montpellier, Campus Agropolis) au sein du laboratoire "Maladies Infectieuses & Vecteurs : Ecologie, Génétique, Evolution & Contrôle" (MIVEGEC), Département "Perturbation & virulence", équipe "Virostyle". Le travail sera effectué dans un groupe s'intéressant à la coévolution antagoniste intervenant dans le contexte plus général du bio-contrôle et de la thérapie phagique.

Contraintes et risques

Le travail se fera principalement en laboratoire de sécurité L2

Informations complémentaires

Pour les personnes pré-sélectionnées, nous réaliserons une interview en visio-conférence. Dans votre dossier écrit et CV, merci de fournir les contacts des personnes avec qui vous avez travaillées par le passé. Il conviendra d'être réactif parce que les délais de signatures de contrat avec le CNRS seront très courts. Merci de votre compréhension.

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