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Portail > Offres > Offre UMR5290-IGNGON-007 - Chercheuse/eur postdoctorale/ en transcriptomique/protéomique fonctionnelle et évolutive (H/F)

Chercheuse/eur postdoctorale/ en transcriptomique/protéomique fonctionnelle et évolutive (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 11 décembre 2020

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Informations générales

Référence : UMR5290-IGNGON-007
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 20 novembre 2020
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Selon expérience, à partir de 32000 € bruts annuelles
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le contexte scientifique globale de notre recherche est l'étude de la fidélité et de l'efficacité de la transmission de l'information biologique DNA>>RNA>>protéines, et des implications de cette fidélité dans la fitness virale et cellulaire.
La question de recherche pour la chercheuse/chercheur postdoctoral sera l'étude de l'impact moléculaire et le coût sur les fitness cellulaire du biais d'usage de codons affectant la transcription et la traduction. Spécifiquement, la chercheuse/chercheur sera impliqué.e dans les études génomiques des polyomavirus BK dans le contexte de PVAN.

Activités

- Analyse comparative de données génomiques issues du séquençage de génomes viraux à partir d'échantillons biologiques humains
- Analyse de diversité génomique, études d'évolution en séries temporelles, inférence phylogénétique.
- Analyse statistique poussée de données, interprétation de résultats, génération de rapports.
- Si nécessaire, développement de méthodologies.
- Contribution à la conception et suivi d'expériences de sélection et de compétition biologique.

- Lecture régulière d'articles.
- Rédaction d'articles scientifiques.
- Contribution à la vie scientifique de l'équipe.
- Formation et encadrement d'étudiants.
- Contribution à la formation et à l'encadrement technique d'autres utilisateurs des outils bioinformatiques.

Compétences

-Expérience avec traitement de NGS avec PacBIO.
-Connaissances des polyomavirus, leur évolution et de leur implication dans la PVAN.
- Forte motivation et véritable intérêt par la biologie évolutive.
-Capacité de travail en équipe et d'interaction avec des experts en bioinformatique et en biologie expérimentale.
- Bioinformatique: analyse de données transcriptomiques et protéomiques ; utilisation avancée de R et d'un langage de programmation script ; mise en place de pipelines bioinformatiques robustes et répétables.
- Biologie évolutive : le projet mobilise des concepts complexes de biologie évolutive (transfert d'information biologique, usage de codons, sélection/mutation, sélection multiniveaux, bruit) ainsi que en biologie moléculaire et cellulaire, avec lesquels la personne recrutée devra être familière.

- compétences poussées en analyses statistiques.
- Maîtrise parfaite de l'anglais (lu, écrit et parlé)
- Rédaction et synthèse : le projet est dans une étape de fort potentiel de production scientifique. La personne recrutée aura de grandes capacités de synthèse et de rédaction en anglais, une grande autonomie, à la fois dans la réflexion et dans la mise en place des analyses

Contexte de travail

Contrat associé au grant ANR BKNAb
Contrat pour 6 mois.
Web de l'équipe: http://virostyle.cnrs.fr/
Responsable hiérarchique, Ignacio BRAVO

Contraintes et risques

Plein temps sur le site, sauf missions éventuelles (à Montpellier, en France et à l'étranger).

Informations complémentaires

Inclure via le système (et non pas par email) une lettre de motivation spécifique à cette offre, ainsi que le nom de deux personnes qui puissent être contactées pour demander des références.

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