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Portail > Offres > Offre UMR5175-CHRHAA-002 - Ingénieur d'etudes en bioinformatique (H/F)

Ingénieur d'etudes en bioinformatique (H/F)


Date Limite Candidature : mardi 26 janvier 2021

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Informations générales

Référence : UMR5175-CHRHAA-002
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : mardi 5 janvier 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 7 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 109€ brut mensuel environ
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le rôle de l'ingénieur sera essentiellement de venir en soutien bio-informatique aux biologistes, tant en terme de recherche qu'en terme logistique.

Activités

- Développer et utiliser couramment des méthodes biostatistiques et bioinformatiques, pour analyser, interpréter les résultats.
- Faire de la veille technologique pour connaître les nouvelles techniques et les nouveaux logiciels.
- Former les utilisateurs.
- Principaux types de projets auxquels l'ingénieur participera: séquençage de génomes complets de bactéries (de novo et reséquençage), développement de protocole de mesure de fitness par NGS, transcriptomique, analyse de données de génomique des populations (analyse de données RADSeq, de RNAseq, utilisation de Stacks, …).

Compétences

- Maîtrise de linux, bash
- Connaissance d'outils classiques en génomique : outils de nettoyage des données, de mapping, de variant calling,…
- Capacité à explorer et à mettre en place l'utilisation de nouveaux logiciels/outils en fonction des besoins.
- Développement de pipeline pour les besoins spécifiques d'un projet ou d'une application.
- Maîtrise de l'anglais scientifique
- Forte capacité au travail en équipe et en interaction

Contexte de travail

Le travail sera effectué dans les locaux du CEFE. L'ingénieur disposera d'un ordinateur sous linux adequat pour conduire les analyses qui lui seront demandées. Il aura de plus accès au cluster du CEFE et au cluster MBB.

Informations complémentaires

Contrat dans le contexte de l'ERC HGTCODONUSE
Contrat renouvelable selon disponibilité de financement

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