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Ingénieur d'étude biologiste (H/F), spécialiste séquençage à haut débit


Date Limite Candidature : jeudi 2 février 2023

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Informations générales

Référence : UMR5174-AMAPEL-008
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : jeudi 12 janvier 2023
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 13 février 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2213 et 2485€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Sa mission consiste à participer à la mise en œuvre et au suivi des projets du Laboratoire EDB utilisant les techniques de séquençage à haut débit : traitement et suivi des échantillons, mise en place et suivi de budgets séquençage à haut débit et traitement des données, rédaction de rapports en interaction avec les utilisateurs.

Activités

Activités principales :
- Choix et adaptation des protocoles de préparation et d'analyse d'échantillons de plantes, champignons, sols, invertébrés en biologie moléculaire.
- Mise en pratique des techniques d'extraction d'ADN/ARN, PCR, préparation de librairies NGS.
- Coordination des projets en lien avec les techniques de séquençage à haut débit pour le Laboratoire: organisation et préparation des librairies pour séquençage à haut débit (metabarcoding, shotgun).
- Suivi de la gestion financière liée à ces projets NGS.
- Présentation des résultats.
- Rédaction des rapports et des notes techniques.

Activités associées :
- Encadrement des nouveaux arrivants, personnels techniques et stagiaires, pour l'élaboration et la conduite des protocoles expérimentaux en biologie moléculaire.
- Formation en interne des utilisateurs aux principes et à la mise en œuvre des techniques utilisées.
- Veille scientifique et technologique, en particulier liée aux NGS.
- Participation à la gestion du plateau de technique B2M du Laboratoire.
- Rédaction des protocoles et des notes techniques dans l'unité.
- Application du dispositif d'hygiène et sécurité dans les pièces de laboratoire.

Compétences

Savoirs/connaissances :
- Connaissances approfondies des méthodes utilisées en écologie évolutive (biologie moléculaire, NGS, biochimie)
- Connaissance des procédures d'échantillonnage des communautés animales et végétales au sein de populations de différents groupes taxonomiques.
- Connaissances approfondie des réglementations en matière d'éthique.
- Connaissance de la règlementation en hygiène et sécurité
- Connaissances générales en chimie, mathématiques, physique
Savoir-faire:
- Capacité à conduire des experiences en biologie moléculaire (séquençage haut débit)
- Capacité à contrôler et valider la qualité du fonctionnement des appareils de la plateforme
- Capacité à appliquer et à faire appliquer les textes réglementaires
- Maîtrise des méthodes modernes pour la révélation de la biodiversité (ADN environnemental barcoding et métabarcoding, séquençage haut débit d'amplicons, séquençage de génomes d'organelles)
- Capacité à coordonner les projets du laboratoire (planification, suivi, reporting, adaptabilité).
- Aptitude à s'inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipe.
- Capacité d'innovation et de créativité, d'initiative et autonomie dans le travail.
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique du domaine (expression et compréhension écrites et orales de niveau 1).
Savoirs-être :
- Aptitude confirmée au dialogue.
- Qualités relationnelles et de diplomatie.
- Capacités d'écoute et de communication

Contexte de travail

Le plateau technique B2M (Biologie moléculaire et microbiologie) à EDB est au service de la communauté de recherche pour l'exploration de la diversité génétique, spécifique et fonctionnelle, dans un large spectre d'applications relevant de l'écologie, environnement et biologie évolutive

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