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Portail > Offres > Offre UMR5089-DAVBOU-001 - Ingénieur-e H/F d'études en calcul scientifique

Ingénieur-e H/F d'études en calcul scientifique


Date Limite Candidature : mercredi 21 avril 2021

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Informations générales

Référence : UMR5089-DAVBOU-001
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : mercredi 31 mars 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 17 mai 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2088€ et 2351€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le(la) candidat(e) aura pour mission de modéliser des données issues d'analyses protéomiques basées sur la spectrométrie de masse de type nano-LC-MS/MS. Il(elle) entraînera des algorithmes d'apprentissage machine (« machine learning ») sur des jeux de données produits par le laboratoire de protéomique pour effectuer différents types de prédictions.

Activités

- Exploiter et transformer les données de spectrométrie de masse issues des logiciels bioinformatiques dédiés.
- Choisir les méthodes d'apprentissage machine les plus adaptées aux modélisations testées dans le laboratoire.
- Réaliser des tests de modélisation et évaluer différents modèles afin de sélectionner les meilleurs.
- Développer des scripts informatiques afin d'automatiser les calculs.
- Adapter les scripts développés aux logiciels déjà développés par le laboratoire.
- Interagir avec les chercheurs et ingénieurs de l'équipe pour s'assurer de la pertinence des résultats obtenus.
- Rédiger des documents techniques et utilisateurs, relatifs aux outils développés.
- Présenter oralement les travaux réalisés aux collaborateurs.

Compétences

- Expertise technique des méthodes d'apprentissage profond utilisé dans le domaine de l'intelligence artificielle : connaissance des différentes architectures de réseaux de neurones et maîtrise d'outils d'aprrentissage (exemples : TensorFlow, PyTorch, Keras)
- Bonne connaissance d'un ou plusieurs langages de script (Python et R notamment)
- Connaissances de base sur la biologie des protéines
- Capacité de travail en équipe et adaptabilité
- Rigueur et autonomie
- Bonne qualité rédactionnelle
- Maîtrise de l'anglais écrit

Contexte de travail

La personne recrutée sera intégrée à l'équipe “Protéomique et Spectrométrie de Masse des Biomolécules” de l'Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS, UMR 5089) à Toulouse, dirigée par Odile Schiltz. Cette équipe abrite la plateforme protéomique de Toulouse et constitue l'un des trois nœuds de l'Infrastructure Nationale en Protéomique, ProFI. Elle est composée d'une vingtaine de personnes avec des expertises complémentaires en spectrométrie de masse, biochimie et bioinformatique, et est dotée d'une instrumentation de pointe ainsi que d'une solide infrastructure informatique. La mission sera effectuée sous la responsabilité du responsable de l'équipe et de la plateforme.

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