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Expert-e en Calcul HPC (H/F)


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Informations générales

Référence : UMR5004-CECABA-010
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : mardi 8 octobre 2019
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 1 décembre 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2400 - 2600 brut selon experience
Niveau d'études souhaité : Ingénieur
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

La personne recrutée travaillera au développement d'une solution logicielle à l'interface de la biologie et des mathématiques dans le cadre d'un programme de maturation soutenu par la SATT AxLR et Agropolis Fondation.
La personne recrutée aura pour mission l'implémentation d'un logiciel de calcul Big DATA (en développement) sur un cluster de calcul multi GPU et multi noeuds.

Activités

Implémentation interface Homme/machine (CLI/web)
Implémentation interface Machine/Machine online
Implémentation de la partie gestion des jobs
Implémentation Kernel CUDA pour le noyau de calcul
Participation aux échanges entre les différents acteurs impliqués sur le projet
Validation de la solution logicielle sur des données réelles de plantes
Formaliser et rédiger les différents documents techniques relatifs à la solution logicielle.

Compétences

Les candidats doivent:
- Maîtriser le C++ et le CUDA (obligatoire)
- Posséder une aptitude au travail en équipe (laboratoire multidisciplinaire Info/Math/Bio)
- Posséder une capacité à travailler dans le respect des règles et procédures
- Pouvoir travailler en autonomie
- Posséder des capacités d'initiatives et être force de propositions
- Posséder une bonne capacité organisationnelle et capacité à rendre compte du travail accompli
- Maitriser Linux
- Une expérience en Big DATA/HPC est nécessaire.

- Networking
- Multithreading

- Notions de génétique (niveau Licence)
- Niveau de mathématique : (niveau Licence)

Contexte de travail

La personne recrutée travaillera en partenariat avec les différents coordinateurs du projet : Gabriel KROUK (UMR BPMP), André MAS (UMR IMAG), Julie CLAR (SATT AxLR) et Camille CLEMENT (Agropolis Fondation). La personne recrutée sera formée par un data-scientist expert. Le poste est localisé au sein du laboratoire de Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (B&PMP -UMR 5004).Le travail s'inscrit dans un projet interdisciplinaire ayant pour but de construire une solution logicielle a l'interface de la biologie et des mathématiques. Un goût pour l'interdisciplinarité (notions de biologie) sera donc requis pour communiquer avec les acteurs du projet.

Contraintes et risques

Travail sur ordinateur

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