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Portail > Offres > Offre UMR3664-ANTCOU-003 - Postdoc (H/F) en physique théorique: Dynamique 4D du génome

Postdoc (H/F) en physique théorique: Dynamique 4D du génome

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

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Informations générales

Référence : UMR3664-ANTCOU-003
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : lundi 30 septembre 2019
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 13 novembre 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2695,56 et 3841,41 € brut mensuel, selon qualifications et expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Notre équipe “Dynamique Spatio-temporelle des fonctions génomiques” étudie l'organisation 3D des chromosomes dans le noyau cellulaire et son rôle dans la régulation de l'expression des gènes.

Nous utilisons un ensemble de techniques d'imagerie de molécules uniques, sur échantillons vivants et fixés, permettant de marquer ADN, ARN et protéines dans le noyau. Notre groupe interdisciplinaire développe également des outils computationnels pour l'analyse de données et des modèles physiques du génome et du noyau.
Pour plus d'info : www.coulonlab.org

Vous serez le/la spécialiste de l'équipe en modélisation de phénomènes physiques et analyse de données.

Activités

Vous participerez à plusieurs projets de l'équipe en :
• analysant les données issues de mesures d'imagerie sur cellules vivantes et fixées (en collaboration avec un ingénieur en analyse d'image dans l'équipe)
• élaborant des modèles physiques des phénomènes étudiés, afin d'interpréter les résultats expérimentaux et de proposer des hypothèses testables.

Dans ce contexte, vous serez amené(e) à proposer des outils de modélisation et d'analyse qui s'appliqueront également à d'autre données publiquement disponibles.

Les projets de l'équipe sur lesquels vous serrez impliqué(e) incluent :
• le suivi 4D de loci génomiques (gènes, enhancers, bordures de domaines génomiques, éléments répétés) en cellules vivantes sur une gamme large d'échelles spatiales, temporelles et génomiques, permettant de comprendre les phénomènes sous-jacents à l'organisation dynamique des chromosomes.
• la coordination entre l'activité transcriptionnelle de gènes et leur relation spatiale, mesurées avec des technique d'imagerie d'ARN uniques en cellules vivantes et fixées (MS2/PP7, RNA FISH, Oligopaint/MERFISH), afin de comprendre les liens entre l'organisation 3D du génome et la régulation de son expression.

Compétences

[ *** : requis     ** : recommandé     * : apprécié ]

*** Doctorat en Physique
** Expérience en modélisation de polymères pour l'organisation du génome

Compétences avancées en :
*** Physique statistique hors d'équilibre
*** Mathématiques des processus stochastiques
** Processus de diffusion en milieu désordonné
** Théorie du signal domaine fréquentiel

Programmation et calcul scientifique :
*** Python, SciPy
* Calcul parallélisé et sur cluster (CentOS)
* Bases en bioinformatique (en particulier données de Hi-C)

*** Maîtrise de l'anglais (écris et oral) qui est la langue de travail de l'équipe
** Organisation, autonomie, capacité à communiquer et à présenter des résultats

Contexte de travail

Notre équipe est co-affiliée à une unité de recherche en biologie (Dynamique du Noyau, UMR3664) et une unité de recherche en physique (Physico-Chimie Curie, UMR168) à l'Institut Curie. Vous travaillerez en étroite collaboration avec les expérimentateurs de l'équipe.

Informations complémentaires

Veuillez candidater sur le 'Portail Emploi' du CNRS avec une lettre de motivation et votre CV.

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