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Portail > Offres > Offre UAR3601-JACVAN-003 - Développeur•euse web H/F

Développeur•euse web H/F


Date Limite Candidature : mardi 24 mai 2022

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Informations générales

Référence : UAR3601-JACVAN-003
Lieu de travail : EVRY COURCOURONNES
Date de publication : mardi 3 mai 2022
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2172,74 brut selon experience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Dans le cadre du projet ABRomics qui vise à développer une plateforme numérique pour l'antibiorésistance (cf. section contexte), l'IFB recrute un développeur Web (H/F). La personne recrutée aura pour principale mission de contribuer à la mise en place du portail d'analyse et d'interrogation de la base de données ABRomics à destination des cliniciens et utilisateurs de la plateforme.

Activités

- Concevoir et développer des bases de données
- Développer le moteur d'exécution lié au Framework Galaxy Project permettant la soumission et la gestion des analyses
- Participer à des réunions avec les différentes plateformes du consortium concernant le développement de l'interface utilisateur et des bases de données
- Développer l'interface utilisateur permettant la gestion des données
- Concevoir et développer des interfaces utilisateurs (GUI) et des interfaces programmatiques (API)
- Rédiger la documentation pour les usagers, les administrateurs et les développeurs,
- Assurer une veille technologique
Participer à l'assistance et au support utilisateur

Compétences

EXPERIENCES:
- Master en Bioinformatique ou informatique
- Une expérience de framework web est un pré-requis (Django est un plus)
- Une expérience UX design front office est un plus
- Une expérience dans le développement collaboratif (ex, GitHub/GitLab) et de ressources ouvertes est un plus

CONNAISSANCES:
- Conception de modèles de base de données et d'architectures Modèle-Vue-Contrôleur
- Bonne connaissance du modèle objet et des principaux patrons de conception (design patterns).
- Bonne connaissance de l'outil de versionning Git et des outils associés: Github, Gitlab
- Bonne connaissance de l'intégration et du déploiement de services Web et API sur une infrastructure (django/python)
- Bonne connaissance de la conception et du requêtage de bases de données SQL
- Une connaissance de Javascript sera considérée comme un avantage
- Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
- Langue française B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

COMPETENCES OPERATIONNELLES:
- Frameworks Web
- Python 3
- Systèmes de contrôle de version : git
- Django
- Javascript
- Cycles de développement et de gestion logicielle
- Formats d'échange de données (e.g. JSON, XML, YAML)
- Base de données Postgresql
- La connaissance de compétence DevOps est un plus : intégration continue, Ansible, ...

COMPETENCES COMPORTEMENTALES:
- Travail en équipe
- Travail à distance
- Communication, écoute et dialogue avec des collaborateurs d'autres disciplines, afin d'exposer les options technologiques et de discuter de leurs conséquences.
- Autonomie, Rigueur
- Être force de proposition

Contexte de travail

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB ; france-bioinformatique.fr) est une infrastructure nationale en biologie-santé (INBS) qui fédère 36 plateformes et équipes régionales de bioinformatique et une unité coordinatrice, IFB-core (Unité d'Appui à la Recherche, UAR CNRS 3601). L'IFB est également le nœud français de l'Infrastructure de Recherche européenne en bioinformatique ELIXIR (ESFRI). l'IFB a pour mission d'offrir un appui à la recherche en science du vivant en déployant une infrastructure numérique, des ressources logicielles, des services en bioinformatique et des formations en anticipant les développements futurs du domaine et de en participant aux innovations méthodologiques. Les activités de l'IFB couvrent la diversité des domaines thématiques de toutes ses tutelles : recherche fondamentale, santé, environnement et agronomie.

L'IFB est impliqué dans plusieurs projets applicatifs nationaux d'envergure dans différents domaines des Sciences de la Vie et de la Santé dont le projet ABRomics qui vise à développer une plateforme numérique pour collecter, analyser, organiser et rendre accessibles les données omiques (génomiques, métagénomique, protéomiques, …) des maladies infectieuses bactériennes et leurs métadonnées cliniques et épidémiologiques concernant la résistance aux antibiotiques. Le projet repose sur un réseau de chercheurs de 44 équipes comprenant des épidémiologistes, des microbiologistes cliniques, des bioinformaticiens et mathématiciens et la communauté de recherche au sens large. ABRomics fournira une infrastructure unique de stockage et d'analyse des données dont le développement sera assuré par une équipe incluant des compétences en DevOps, développement de bases de données et de logiciels, gestion des données et analyse des données.

Dans ce contexte, l'IFB recrute un développeur Web afin de contribuer à la mise en place du portail d'analyse et d'interrogation de la base de données ABRomics. L'interface utilisateur simple et ergonomique permettra le lancement de workflows d'analyse développés par le consortium et s'appuiera sur l'instance usegalaxy.fr pour le chaînage des outils et la soumission des jobs sur le cluster de l'IFB. La personne recrutée rejoindra une équipe distribuée de 6 personnes dédiées au développement de la version beta de la plateforme ABRomics (cf. section “informations complémentaires”).

Informations complémentaires

***NOTE D'ATTENTION***:
Pour des raisons administratives le poste est affiché sur Evry, mais il SERA LOCALISE sur la plateforme Hub Bioinfo de l'Institut Pasteur (PARIS, 15ème) ou sur la plateforme ABiMS (Roscoff). La personne s'intégrera dans son équipe d'accueil et sera directement encadrée par un ingénieur local. Elle participera, sur site et en télétravail, aux groupes de travail de l'IFB et du projet ABRomics pertinents pour sa mission.
Le travail nécessitera des déplacements occasionnels en France et à l'étranger pour participer à des réunions, des formations ou des événements scientifiques.

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