En poursuivant votre navigation sur ce site, vous acceptez le dépôt de cookies dans votre navigateur. (En savoir plus)
Portail > Offres > Offre FR550-BRUMIR-010 - Post-doctorat dans le domaine de la régulation de la fonction/dysfonction des mitochondries par ultrasons focalisés (H/F)

Post-doctorat dans le domaine de la régulation de la fonction/dysfonction des mitochondries par ultrasons focalisés (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 29 octobre 2021

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler. Les informations de votre profil complètent celles associées à chaque candidature. Afin d’augmenter votre visibilité sur notre Portail Emploi et ainsi permettre aux recruteurs de consulter votre profil candidat, vous avez la possibilité de déposer votre CV dans notre CVThèque en un clic !

Faites connaître cette offre !

Informations générales

Référence : FR550-BRUMIR-010
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : vendredi 17 septembre 2021
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Les salaires bruts varieront en fonction de l'expérience du candidat à partir de 3106€/mois (environ 2500€ net) pour un candidat ayant moins de 2 ans d'expérience post-doctorale. Consultez le barème officiel CNRS des salaires des chercheurs sur : http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Attention : Vous ne devez pas avoir résidé ou exercé votre activité principale (par exemple travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant la date de recrutement.

Développement et application de nouvelles méthodes de simulation hors équilibre pour démêler le mécanisme moléculaire sous-jacent de la façon dont les ultrasons focalisés influencent l'activité des canaux ioniques et conduisent à la régulation de la fonction/dysfonctionnement mitochondrial.
PI: Phuong H. Nguyen, UPR9080; nguyen@ibpc.fr

Publications liées au projet:
[1] B. O'Rourke. Mitochondrial ion channels. Annu. Rev. Physiol. 2007, 69, 19
[2] Testai, S. Rapposelli, A. Martelli, M. C. Breschi and V. Calderone. (2015). Mitochondrial potassium channels as pharmacological target for cardioprotective drugs. Med. Res. Rev. 2015, 35, 520
[3] R. J. Stephens, C. A. Torbit, D. G. Groth, J. C. Taenzer and P. D. Edmonds. Mitochondrial Changes Resulting from Ultrasound Irradiation. Ultrasound in Medicine 1978, 591.
[4] V. A. Selivanov, V. P. Zinchenko and A. P. Sarvazian. Mechanism of low intensity ultrasound effect on mitochondria. Biofizika 1982, 27, 653
[5] K. Lin, Z. Lin, Y. Li, Y. Zheng and D. Zhang. Ultrasound-induced reactive oxygen species generation and mitochondria-specific damage by sonodynamic agent/metal ion-doped mesoporous silica. RSC Adv. 2019, 9, 39924
[6] V. H. Man, P. Derreumaux, P. H. Nguyen. Nonequilibrium all-atom molecular dynamics simulation of the ultrasound induced bubble vibration and application to dissociate amyloid fibrils. J. Chem. Phys. 2016, 145, 174113
[7] V. H. Man, P. M. Truong, M. S. Li, J. Wang, V. O. Nguyen-Thi, P. Derreumaux and P.H. Nguyen. Molecular mechanism of the cell membrane pore formation induced by bubble stable cavitation. J. Phys. Chem. B. 2019, 123, 71.
[8] V. H. Man, M.S. Li, J. Wang, P. Derreumaux and P.H. Nguyen. Interaction mechanism between the focused ultrasound and lipid membrane at the molecular level. J. Chem. Phys. 2019, 150, 215101.
[9] V. H. Man, M.S. Li, J. Wang, P. Derreumaux, T. T. Nguyen, S. Nangia and P.H. Nguyen. Molecular mechanism of ultrasound interaction with a blood brain barrier model. Chem. Phys. 2020, 153, 045104.
[10] V. H. Man, M.S. Li, J. Wang, P. Derreumaux and P.H. Nguyen. Molecular Mechanism of Ultrasound Induced Structural Defects in Liposomes: a Nonequilibrium Molecular Dynamics Simulation Study. Langmuir 2021, 37, 7945

Activités

-Construire un modèle atomistique des membranes lipidiques des mitochondries incorporant des canaux ioniques
-Développement d'une méthode de simulation de dynamique moléculaire hors équilibre couplée aux ultrasons et au champ électrique externe
-Faire des simulations à l'aide des modèles membranes et des méthodes de simulation développés
-Analysez les données de simulation pour comprendre le processus de perméation ionique, les changements de conformation des protéines et les réarrangements lipidiques à l'échelle atomistique avec une échelle de temps allant de la picoseconde à la microseconde
- Collaborerez avec d'autres membres du groupe de recherche
- Responsable de rapporter et de publier les résultats obtenus

Compétences

Compétences:
-Connaissance de la simulation de dynamique moléculaire
-Quelques connaissances en programmation avec fortran ou C++

Savoir-faire:
- Concevoir et mettre en œuvre les protocoles expérimentaux
- Capacités d'analyse et de restitution des informations
- Préparer des articles pour publication dans des revues internationales à comité de lecture

Savoir-être:
-Innovation, rigueur et fiabilité dans l'exécution du travail.
-Sens de l'organisation.
-Aptitude à travailler en équipe

Contexte de travail

Le travail sera mené au sein du laboratoire d'accueil UPR9080 “Laboratoire de Biochimie Théorique”, dirigé par Dr. Marc Baaden, et par le co-directeur Dr. Chantal Prévost, à l'Institut de Biologie-Physico-chimique à Paris (www-lbt.ibpc.fr). Ce laboratoire, situé au cœur du quartier latin regroupe un peu plus de 30 personnes dont 14 membres statutaires. Le projet se fera sous la direction de Phuong Nguyen.

Le projet s'inscrit dans le programme COFUND FP-DYNAMO-PARIS, initiative pour la recherche fondamentale, qui offre un environnement interdisciplinaire dans le centre de Paris afin de former les scientifiques de demain dans le domaine de la biologie physico-chimique. Le but de ce programme de recherche est d'intégrer les connaissances sur l'expression génétique, la biologie membranaire et structurale, et la bioénergétique chez les bactéries, les chloroplastes et les mitochondries dans le contexte général d'améliorer notre compréhension de la biogenèse des membranes transductrices d'énergie. Ces études impliquent l'utilisation de technologies de pointes incluant la biologie structurale (NMR, cristallographie aux rayons X et CryoEM), la transcriptomique, la spectrométrie de masse, la biologie synthétique, la microfluidique, la modélisation computationnelle et la visualisation. Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires. Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires. Ils bénéficieront de l'encadrement d'experts reconnus internationalement dans leurs domaines, d'un réseau mondial d'institutions de renom, d'infrastructures de recherche et d'un savoir-faire technique de pointe qui leur permettront de perfectionner leurs compétences scientifiques, de se faire connaître et d'accroître leur compétitivité sur le marché du travail. Une formation spécifique sera proposée aux post- doctorants à travers la participation au cours EMBO sur « Le leadership de laboratoire pour les postdoctorants » lors d'une retraite à Padoue, et par leur participation à des événements de formation complémentaires dédiés aux
compétences non techniques.

Contraintes et risques

Le contrat doit démarrer entre le 1er Janvier 2022 et le 31 Mai.

Informations complémentaires

Le dossier de candidature est à rédiger en anglais et à déposer sur le site https://emploi.cnrs.fr/. Il doit comporter un CV détaillé, un minimum de deux lettres de référence, une lettre de motivation décrivant vos objectifs de carrière à court et long terme, ainsi qu'une déclaration signée spécifiant que vous êtes en conformité avec la règle de mobilité qui stipule que vous n'avez pas résidé ou exercé votre activité principale (travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des trois années précédant la date du recrutement. Le dossier complet doit aussi être envoyé à Bruno MIROUX & Magdalena TORTYNA, respectivement directeur et manager du projet à l'adresse mail DYNAMOcofund@ibpc.fr (Tel: 33 1 58 41 50 64). Voir détails sur le site http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/

Evaluation
Le poste est conçu comme une première étape dans une carrière de chercheur, et l'évaluation des candidats sera principalement basée sur leurs qualifications en recherche et leurs compétences pouvant compléter et renforcer la recherche en cours au sein des institutions partenaires.

Étape 1. Les candidatures de chaque candidat éligible seront évaluées par des experts internationaux indépendants au sein du thème de recherche concerné. Les candidats éligibles seront évalués en fonction de leur mérite, de leur motivation pour le programme, de leur excellence académique et de leurs qualifications personnelles telles que leur aptitude à collaborer et communiquer.

Étape 2. Un maximum de trois candidats sera retenu pour un entretien vidéo avec les experts indépendants pour chaque poste ouvert (novembre 2021). Après l'entretien, les candidats de la liste restreinte seront invités à une conférence à distance avec le directeur de projet et un membre du conseil d'administration de DYNAMO pour définir le périmètre général du projet, de la formation et de l'environnement de recherche. Les candidats devront rédiger une proposition de projet de 3 pages, apportant leurs propres idées originales, et disposeront de 2 semaines pour la soumettre.

Étape 3. Chaque proposition de projet sera évaluée par l'un des experts indépendants et le membre du conseil d'administration de DYNAMO qui aura évalué le candidat lors des étapes précédentes. La sélection finale sera faite sur la base des notes obtenues aux étapes 1, 2 et 3. La note minimale doit être supérieure à 20/40. Le meilleur candidat se verra offrir le poste de postdoctorant avec une date de début allant du 1er janvier au 31 mail 2022.

Le CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) est un employeur souscrivant au principe de l'égalité d'accès à l'emploi. Par ailleurs, FP-DYNAMO-PARIS s'engage à promouvoir le rôle des femmes dans la science et ainsi encourage explicitement celles-ci à se porter candidates.

On en parle sur Twitter !