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Post-doctorat "Etude de la compétition biotique dans le phytoplancton via le prisme des membranes thylakoïdiennes" (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 29 octobre 2021

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Informations générales

Référence : FR550-BRUMIR-006
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : vendredi 17 septembre 2021
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Les salaires bruts varieront en fonction de l'expérience du candidat à partir de 3106€/mois (environ 2500€ net) pour un candidat ayant moins de 2 ans d'expérience post-doctorale. Consultez le barème officiel CNRS des salaires des chercheurs sur : http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Attention: Vous ne devez pas avoir résidé ou exercé votre activité principale (par exemple travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant la date de recrutement.
Vous avez une expérience de la recherche dans le domaine concerné par l'annonce.


Nous cherchons un(e) collaborateur(trice) chercheur(e) post-doctorant(e) ayant des connaissances dans les domaines de la biologie des diatomées, de la photosynthèse, de la biophysique et de la bioénergétique cellulaire, pour rejoindre le Laboratoire d'Excellence (Labex) Dynamo affilié à l'IBPC. Le projet est financé pour étudier la compétition biotique entre les microalgues marines à travers le prisme de l'intégrité et de la fonction de leurs membranes thylakoïdes et sera effectué dans le laboratoire de "Biologie du chloroplaste et perception de la lumière chez les microalgues" (UMR7141 CNRS / Université Sorbonne, http://www.ibpc.fr/UMR7141). Ce laboratoire étudie les processus induits par la lumière (photosynthèse et photoperception) et la biologie des chloroplastes.

Le post-doctorant(e) sera impliqué(e) dans un projet visant à étudier la compétition biotique entre espèces du phytoplancton. Elle/il se basera sur une nouvelle méthodologie développée récemment au laboratoire permettant de mesurer la photosynthèse de plusieurs espèces dans un mélange et l'utilisera pour étudier les interactions allélopathiques ciblant la photosynthèse, ainsi que la compétition pour les nutriments. Un criblage récent au sein de la collection de microalgues de la Station biologique de Roscoff a révélé des événements fréquents d'inhibition de la photosynthèse d'une microalgue par une autre, certains d'entre eux étant médiés par une carence en nutriments. Un exemple est l'inhibition de l'activité photosynthétique des diatomées (Thalassiosira pseudonana, Phaeodactylum tricornutum, Skeletonema costatum) par un dinoflagellé via le découplage des membranes thylacoïdiennes, empêchant la synthèse d'ATP. Dans ce contexte, le projet postdoctoral vise à i) disséquer davantage le mécanisme de l'allélopathie et le rôle du statut nutritionnel dans la compétition biotique entre dinoflagellés et diatomées, ii) étendre le criblage pour identifier de nouvelles interactions allélopathiques dans le phytoplancton, et iii) préparer à plus long terme la possibilité d'étudier la compétition biotique sur le terrain.
PI: Benjamin Bailleul, UMR7141; bailleul@ibpc.fr

Publications liées au projet :
Bailleul, B., Cardol, P., Breyton, C., & Finazzi, G. (2010). Electrochromism: a useful probe to study algal photosynthesis. Photosynthesis research, 106(1), 179-189.

Activités

Le projet combinera du développement méthodologique et des études mécanistiques de la photosynthèse du phytoplancton, basées sur des approches génétiques, biochimiques et biophysiques.
Le(la) candidat(e) devra :
- contribuer à la conception du projet,
- en développer les méthodologies,
- réaliser les expériences,
- analyser et communiquer les données,
- gérer les collaborations,
- rédiger les publications.

Compétences

Les candidats doivent être titulaire d'un doctorat en biologie à la date du recrutement et faire preuve d'une solide expérience dans les techniques de biophysique appliquée à la photosynthèse des microalgues et d'un intérêt marqué pour l'écologie du phytoplancton. Son CV et sa liste de publications devront être d'un niveau compatible avec l'exigence des programmes postdoctoraux nationaux et internationaux. Une expertise préalable en génétique, en biochimie et/ou en biologie moléculaire sera fortement appréciée – des analyses transcriptomique/protémique sont prévues.

Savoir-faire :
-Concevoir et mettre en œuvre les protocoles expérimentaux
-Capacités d'analyse et de restitution des informations (tenue d'un cahier de laboratoire, préparation de tableaux de synthèse des résultats, préparation de présentations orales).
-Préparer des articles pour publication dans des revues internationales à comité de lecture

Savoir-être
-Innovation, rigueur et fiabilité dans l'exécution du travail.
-Sens de l'organisation.
-Aptitude à travailler en équipe

Contexte de travail

L'Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC), créé en 1930 par la Fondation Edmond de Rothschild, se consacre aux recherches multidisciplinaires dans tous les domaines de la biologie. Les bases structurelles, génétiques et physico-chimiques des organismes vivants sont explorées à différents niveaux d'intégration, de la molécule à l'organisme entier. Le(la) post-doctorant(e) intégrera le laboratoire de "Biologie du chloroplaste et perception de la lumière chez les microalgues" (UMR7141) dirigé par le Dr Angela Falciatore. Il comporte une vingtaine de membres permanents (chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et administratifs) et une quinzaine de collaborateurs temporaires, doctorants et post-doctorants. Ce laboratoire, dédié à l'étude des processus induits par la lumière (photosynthèse et photoperception) et de la biologie du chloroplaste, aborde des questions clés sur la biologie, l'évolution et l'écologie des microalgues en se concentrant sur différents organismes modèles (l'algue verte Chlamydomonas reinhardtii et la diatomée Phaeodactylum tricornutum) et sur des espèces phytoplanctoniques d'importance écologique, étudiées par des approches écophysiologiques, biophysiques, biochimiques, génomiques et génétiques.
Le projet se fera sous la direction de Benjamin Bailleul .

Le projet s'inscrit dans le programme COFUND FP-DYNAMO-PARIS, initiative pour la recherche fondamentale, qui offre un environnement interdisciplinaire dans le centre de Paris afin de former les scientifiques de demain dans le domaine de la biologie physico-chimique. Le but de ce programme de recherche est d'intégrer les connaissances sur l'expression génétique, la biologie membranaire et structurale, et la bioénergétique chez les bactéries, les chloroplastes et les mitochondries dans le contexte général d'améliorer notre compréhension de la biogenèse des membranes transductrices d'énergie. Ces études impliquent l'utilisation de technologies de pointes incluant la biologie structurale (NMR, cristallographie aux rayons X et CryoEM), la transcriptomique, la spectrométrie de masse, la biologie synthétique, la microfluidique, la modélisation computationnelle et la visualisation. Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires.
Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires. Ils bénéficieront de l'encadrement d'experts reconnus internationalement dans leurs domaines, d'un réseau mondial d'institutions de renom, d'infrastructures de recherche et d'un savoir-faire technique de pointe qui leur permettront de perfectionner leurs compétences scientifiques, de se faire connaître et d'accroître leur compétitivité sur le marché du travail. Une formation spécifique sera proposée aux post-doctorants à travers la participation au cours EMBO sur « Le leadership de laboratoire pour les postdoctorants » lors d'une retraite à Padoue, et par leur participation à des événements de formation complémentaires dédiés aux compétences non techniques.

Contraintes et risques

Le contrat doit démarrer entre le 1er Janvier 2022 et le 31 Mai.

Informations complémentaires

Modalités de candidature
Le dossier de candidature est à rédiger en anglais et à déposer sur le site https://emploi.cnrs.fr/. Il doit comporter un CV détaillé, un minimum de deux lettres de référence, une lettre de motivation décrivant vos objectifs de carrière à court et long terme, ainsi qu'une déclaration signée spécifiant que vous êtes en conformité avec la règle de mobilité qui stipule que vous n'avez pas résidé ou exercé votre activité principale (travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des trois années précédant la date du recrutement. Le dossier complet doit aussi être envoyé à Bruno MIROUX & Magdalena TORTYNA, respectivement directeur et manager du projet à l'adresse mail DYNAMOcofund@ibpc.fr (Tel: 33 1 58 41 50 64). Voir détails sur le site http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/

Evaluation
Le poste est conçu comme une première étape dans une carrière de chercheur, et l'évaluation des candidats sera principalement basée sur leurs qualifications en recherche et leurs compétences pouvant compléter et renforcer la recherche en cours au sein des institutions partenaires.

Étape 1. Les candidatures de chaque candidat éligible seront évaluées par des experts internationaux indépendants au sein du thème de recherche concerné. Les candidats éligibles seront évalués en fonction de leur mérite, de leur motivation pour le programme, de leur excellence académique et de leurs qualifications personnelles telles que leur aptitude à collaborer et communiquer.

Étape 2. Un maximum de trois candidats sera retenu pour un entretien vidéo avec les experts indépendants pour chaque poste ouvert (novembre 2021). Après l'entretien, les candidats de la liste restreinte seront invités à une conférence à distance avec le directeur de projet et un membre du conseil d'administration de DYNAMO pour définir le périmètre général du projet, de la formation et de l'environnement de recherche. Les candidats devront rédiger une proposition de projet de 3 pages, apportant leurs propres idées originales, et disposeront de 2 semaines pour la soumettre.

Étape 3. Chaque proposition de projet sera évaluée par l'un des experts indépendants et le membre du conseil d'administration de DYNAMO qui aura évalué le candidat lors des étapes précédentes. La sélection finale sera faite sur la base des notes obtenues aux étapes 1, 2 et 3. La note minimale doit être supérieure à 20/40. Le meilleur candidat se verra offrir le poste de postdoctorant avec une date de début allant du 1er janvier au 31 mai 2022.

Le CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) est un employeur souscrivant au principe de l'égalité d'accès à l'emploi. Par ailleurs, FP-DYNAMO-PARIS s'engage à promouvoir le rôle des femmes dans la science et ainsi encourage explicitement celles-ci à se porter candidates.

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